目前市場對醫藥行業相對偏高的估值仍存擔憂。從估值上看，醫藥板塊估值水平比年初已經大幅下降，但和2008年的22.25倍的歷史底部相比仍有距離；相對大盤的溢價達150%左右，處于較高水平。由于滬深300的估值水平已經位于歷史低位，再次大幅下降的幾率較小，因此醫藥板塊的估值不是沒有進一步降低的可能。

盡管短期內受整個市場以及抗菌分級管理正式頒布與藥品價格下調等政策影響，醫藥二級市場走勢可能仍將受到一定壓力。但在當前大盤弱市調整的情況下，醫藥板塊長期利好因素仍然存在，其防御性和抗通脹概念仍將受到投資者的關注。

　　未來短期內對醫藥行業將產生較大刺激的將是醫藥生物行業十二五規劃的出臺，但在時間上尚存不確定性。東北證券(000686,股吧)分析師周思立認為，醫藥行業短期難現成長性拐點。從成長性看，醫藥板塊已經連續三個季度營收增速低于30%，凈利潤增速在20%左右。今年上半年，申萬醫藥生物板塊的營業收入同比增長率為21.13%，歸屬于上市公司股東凈利潤的同比增長率為21.17%，銷售毛利率為27.21%。與第一季度相比，變化均不明顯。醫藥生物板塊的營業收入和凈利潤的同比增速在去年第一季度達到頂峰，分別達到31.11%和65.77%，隨后快速回落。

　　由于基數原因，預計下半年的營收和凈利增速或將略有回升，但可能仍在低位徘徊，短期內還看不到加速上漲趨勢的形成。投資者可以從兩方面把握醫藥股的投資機會，第一類是由于新品開發、產能擴張和產品提價等導致業績向好，且估值較低、調整較為充分的成長股；第二類是有定向增發計劃的部分個股。