這時，我們應該反思，在追趕醫藥強國的道路上，我們該如何設計適合中國的路徑?基礎研究和工程技術研究是醫藥創新的“兩條腿”，弱化一方面就會影響前進的步伐。在我國醫藥創新的支持舉措中，應加大對工程技術研究和制劑創新方面的力度，才能轉化成現實的生產力。

　　我國研發效率成問題

　　從1999年開始，國家每年對生物醫藥的投入平均達到20億元，2003年投入高達60億元，并逐年增加。“十一五”期間，中央財政科研投入的31.3%投向了生物醫藥領域的新藥創制、傳染病防治、轉基因等3個重大專項。國家自然科學基金對醫藥領域的資助也在持續增加，2010年單獨設立了醫學科學部，并投入16.2億元，比之前整個生命科學部的總和還多，2011年的投入又大幅增加到32.21億元。“十一五”重大新藥創制專項中，國家投入53億元，地方匹配了200多億元，不僅吸引了很多國內優秀人才，而且通過“千人計劃”和“百人計劃”引進了大批海外創新創業型人才。

　　據統計，我國生物醫藥領域現有科研院所近200家，國家重點實驗室26個，已批準設立國家級生物醫藥產業基地的省市達21個，企業研發機構千余家，醫藥科研單位、高等醫藥院校和綜合大學生命科學院、藥學院的專家與學者數以萬計，形成了一支龐大的研究隊伍。同時，科技部等部門每年立項研究課題數千個;科研論文發表數量已超過美國而躍居世界第一。

　　這樣一組數字讓人們對中國生物醫藥行業充滿期待，然而現實卻不容樂觀。跨國制藥企業正利用其在藥物品牌、質量和技術上的優勢，全面進入中國市場，新制劑、新工藝、新輔料和新設備幾乎全部被外企壟斷。原料藥市場也在面臨挑戰，雖然我國原料藥出口貿易順差較大，但均是缺乏原創性的“Me-Too”藥物，銷售成本增加和利潤下滑讓原料藥企業“腹背受敵”。

　　國內雄厚的資金支持和大批的優秀人才并沒有產生應有的效果，世界生物醫藥產業排名前40位的國家中，中國科研人員最多，投入資金排第4位，而研發綜合實力卻排到第21位，這說明在研發效率上存在較大問題。

　　日本的經驗值得我們借鑒，日本的生物醫藥市場在1998年不過2000億日元，2005年達到6.67萬億日元，占全球生物醫藥市場的10.7%。究其原因是日本進行了一系列的改革，大幅削減了85個基礎研究所的科研基金，加強大學研究機構的獨立性和商業運作能力，鼓勵技術轉讓和商業研究，著力于產出應用成果。