2006年我國醫藥行業累計完成出口交貨值670.59億元，同比增長25.51%。然而良好的出口增長勢頭對我國的醫藥企業而言并不完全是好消息。因為化學原料藥的出口占了44.4%，大量低價出口還招致貿易摩擦。 國家發改委3月20日發布了醫藥行業2006年運行分析及2007年趨勢預測。目前我國已成為世界第二大原料藥生產國，從事原料藥出口的企業已達7000多家。但是貿易摩擦近年來也隨之增加。中國醫藥保健品進出口商會西藥部商品分會秘書長喬海勝表示，一方面，不排除一些國家是在采取貿易保護；另一方面，中國原料藥產品同質化競爭，導致價格未能與出口量同步增長。目前有消息稱，印度又欲對我國的B12和頭孢三嗪進行反傾銷調查。 除原料藥的比重較大外，出口的成品藥多為仿制藥，是我國藥品出口面臨的另外一個難題。喬海勝介紹，目前我國出口的西藥制劑中，97％以上都是仿制藥。 糾其原因，喬海勝認為，首先研發資金不夠。中國藥企的研發投入占銷售額的比例基本在5％以下 ，而美國等大型藥企在15％以上。第二，在我國，科研院所與藥企脫節，導致科研成果很難向市場轉化。再次，我國藥企的市場開發能力欠缺。一個例證就是我國具備知識產權的藥品青蒿素，卻被瑞士諾華公司買斷了。 國家發改委表示，在“十一五”期間，設立醫藥制劑產品出口專項，鼓勵擁有自主知識產權、療效確切、國際市場需求量較大的產品出口，提高醫藥產品的國際競爭力。